Mikrobiološke usluge

Odjel za dijagnostiku urogenitalnih infekcija

• Bakteriološka pretraga urina (urinokultura)
• Pretraga urina i genitalnih uzoraka ( bris cerviksa, bris vagine, bris uretre, ejakulat) na Ureaplasma urealyticum i Mycoplasma hominis

Odjel za dijagnostiku infekcija dišnog sustava, kože i mekog tkiva

• Bakteriološka pretraga uzoraka iz gornjeg i donjeg dijela respiratornog sustava (bris grla, bris nosa, bris nazofarinksa, bris usne šupljine, bris jezika, iskašljaj)
• Dokazivanje prisutnosti antigena BHS-A u brisu ždrijela
• Dokazivanje prisutnosti antigena RSV i Adeno virusa u respiratornim uzorcima
• Dokazivanje prisutnosti antigena virusa gripe A i B u respiratornim uzorcima
• Dokazivanje prisutnosti antigena SARS-CoV-2 virusa u brisu nazofarinksa
• Bakteriološka pretraga urogenitalnih uzoraka ( bris uretre, bris cerviksa, bris vagine, bris vanjskog spolovila i ejakulat)
• Bakteriološka pretraga brisa uretre na Neisseria gonorrhoeae
• Bakteriološka pretraga brisa oka i uha
• Bakteriološka pretraga brisa rane, aspirata rane, brisa kože i mekih tkiva
• Bakteriološka pretraga primarno sterilnih uzoraka (aspirat limfnog čvora, aspirat apscesa, iscjedak iz dojke, bioptat tkiva, intraoperativni bioptat)
• Bakteriološka pretraga perineovaginalnog brisa kod trudnica ( skrinning na BHS-B)
• Bakteriološka pretraga nadzornih briseva u svrhu otkrivanja multirezistentnih bakterija (MRSA, KPC, Acinetobacter baumanii i ostale)
• Bakteriološka pretraga uzoraka na anaerobne bakterije
• Biološka kontrola sterilizacije
• Kontrola provedbe postupaka sterilizacije (obrađeni medicinski otpad)
• Bakteriološka pretraga uzoraka nežive okoline

Odjel za dijagnostiku infekcija probavnog sustava i parazitoze

• Bakteriološka pretraga  stolice na Salmonella spp i/ili Shigella spp
• Bakteriološka pretraga stolice na Campylobacter spp.
• Bakteriološka pretraga stolice na EHEC (Enterohemoragična Escherichia coli) i EPEC (Enteropatogena Escherichia coli)
• Bakteriološka pretraga stolice na Yersinia enterocolitica
• Bakteriološka pretraga stolice na Vibrio cholerae
• Bakteriološka pretraga stolice na VRE (Vankomicin rezistentni Enterococcus)
• Dokazivanje prisutnosti antigena i toksina A/B Clostridium difficile u stolici
• Dokazivanje prisutnosti antigena Helicobacter pylori u stolici
• Parazitološka pretraga stolice na ciste protozoa i jaja helminata
• Pregled perianalnog otiska na Enterobius vermicularis
• Dokazivanje prisutnosti antigena Giardia lamblia, Entamoeba histolytica / Entamoeba dispar, Cryptosporidium parvum u stolici
• Parazitološka pretraga urina na Trichomonas vaginalis
• Strugotina kože na Sarcoptes scabiei
• Pretraga krvi na krvno-tkivne parazite Plasmodium spp. (gusta kap, krvni razmaz)
• Dokazivanje prisutnosti antigena Plasmodium spp
• Dokazivanje prisutnosti antigena Adenovirus i Rotavirus u stolici
• Dokazivanje prisutnosti antigena Norovirus u stolici

Odjel za dijagnostiku tuberkuloze

• Bakteriološka pretraga uzoraka na tuberkulozu (iskašljaj, inducirani iskašljaj, BAL, ispirak bronha, pleuralna tekućina, aspirat dišnih puteva, krv, tkivni uzorci, likvor, ejakulat, menstrualni sekret, lavat želuca, urin, i drugi uzorci)

Odjel za serološku dijagnostiku

• Serološke pretrage za dokaz protutijela na bakterijske antigene

- β- hemolitički streptokok AST-O (antistreptolizinski titar)

- Borrelia burgdorferi (Lyme) IgM, IgG ( EIA,WB)

- Treponema pallidum ( EIA,RPR,TPHA )

- Salmonella spp. ( Widal reakcija aglutinacije )

- Brucella spp. ( Wright reakcija aglutinacije )

- Riketsia spp. ( Weil- Felix reakcija aglutinacije )

- Mycobacterium tuberculosis – IGRA ( Interferon Gamma Release Assay) test (Ag stimulacija limfocita i EIA na interferon gama )

• Serološke pretrage za dokaz protutijela na virusne antigene

- HIV 1/2 ( p24 /anti-HIV1/2)

- Hepatitis A virus (anti HAV total, anti HAV IgM)

- Hepatitis B virus (HBsAg, anti HBc, anti HBcIgM, anti HBs IgG titar, HBe Ag, anti HBe)

- Hepatitis C virus (anti HCV)

- Cytomegalovirus (CMV) IgM, IgG, test avidnosti (AV IgG)

- Virus rubele IgM, IgG

- Epstein-Barr virus (EBV), EBNA 1, VCA IgM, VCA IgG

- Herpes simplex virus 1/2 (HSV 1/2) IgM, IgG

- Virus ospica (Morbili) IgG

- SARS CoV-2 virus IgM, IgG

-  Varicella-zoster virus(VZV) IgG

• Serološke pretrage za dokaz protutijela na parazitarne antigene

- Toxoplasma gondii (TOXO) IgM, IgG, test avidnosti (AV IgG)

- Trichinella spiralis IgG

• Dokazivanje prisutnosti reumatoidnog faktora (RF)

- Waller-Rose test

- RF

- Kvantitativno određivanje C-reaktivnog proteina (CRP)

• Izravno dokazivanje uzročnika bolesti

- Dokazivanje prisutnosti antigena Legionella pneumophila serogrupa 1iz urina

- Dokazivanje prisutnosti antigena Chlamydia trachomatis iz brisa oka

Odjel za dijagnostiku gljivičnih infekcija

• Mikološka pretraga urina, urogenitalnih uzoraka, respiratornih uzoraka, stolice, iskašljaja, brisa uha, brisa jezika, brisa kože, primarno sterilnih uzoraka
• Pretraga na dermatofitne plijesni (strugotina nokta, strugotina kože, strugotina vlasišta)

Odjel za molekularnu mikrobiološku dijagnostiku

• Molekularna dijagnostika bakterijskih infekcija

- Molekularna pretraga na Chlamydia trachomatis

- Molekularna pretraga na Neisseria gonorrhoeae

- Molekularna pretraga na Clostridium difficile

- Detekcija gena koji su odgovorni za rezistenciju na karbapenemaze kod enterobakterija (CRE)

• Molekularna dijagnostika virusnih infekcija

- Molekularna pretraga na Humani papiloma virus (HPV) visokog rizika i genotipizacija HPV 16 i HPV 18

- Molekularna pretraga na Hepatitis B (HBV DNA) (kvantitativno)

- Molekularna pretraga na Hepatitis C (HCV RNA)

- Genotipizacija HCV

- Molekularna pretraga na Cytomegalovirus (CMV) (kvantitativno)

- Molekularna pretraga na SARS-CoV-2

SKRAĆENICE:

AST-O – antistreptolizinski titar

AV IgG – test avidnosti IgG protitijela

BAL – bronhoalveolarni lavat

BHS-A – beta hemolitički streptokok grupe A

BHS-B – beta hemolitički streptokok grupe B

CMV – citomegalovirus

CRE – enterobakterije rezistentne na karbapeneme

CRP – C- reaktivni protein

DNA – deoksiribonukleinska kiselina

EBNA – Epstein-Barrov nuklearni antigen

EBV – Epstein-Barrov virus

EHEC – enterohemoragična Escherichia coli

EIA –  imunoenzimni test

EPEC – enteropatogena Escherichia coli

HAV – virus hepatitisa A

HBV – virus hepatitisa B

HCV – virus hepatitisa C

HIV – virus humane imunodeficijencije

HPV – humani papiloma virus

HSV – herpes simplex virus

IgA – imunoglobulin A

IgG – imunoglobulin G

IgM – imunoglobulin M

IGRA test – test otpuštanja interferona gama

MRSA – meticilin rezistentni Staphylococcus aureus

RF – reumatoidni faktor

RPR – rapid plazma reagin

TOXO – Toxoplasma gondii

TPHA – Treponema palidum hemaglutinacijski test

VRE – vankomicin rezistentni Enterococcus

VZV – varicella zoster virus

WB – Western blot